MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanocaldococcus vulcanius M7 plasmid pMETVU02

Total Repeats: 82

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013409	A	6	6	508	513	100 %	0 %	0 %	0 %	261403874
2	NC_013409	ATT	2	6	534	539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261403874
3	NC_013409	TAT	2	6	543	548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261403874
4	NC_013409	AAG	2	6	549	554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261403874
5	NC_013409	CTA	2	6	606	611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261403874
6	NC_013409	TCGT	2	8	646	653	0 %	50 %	25 %	25 %	261403874
7	NC_013409	CTT	2	6	741	746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261403874
8	NC_013409	ATA	2	6	766	771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261403874
9	NC_013409	TTG	2	6	782	787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261403874
10	NC_013409	ATT	2	6	795	800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261403874
11	NC_013409	TAA	2	6	803	808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261403874
12	NC_013409	AAC	2	6	855	860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261403874
13	NC_013409	TTA	2	6	890	895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261403874
14	NC_013409	A	6	6	930	935	100 %	0 %	0 %	0 %	261403874
15	NC_013409	TA	3	6	1683	1688	50 %	50 %	0 %	0 %	261403875
16	NC_013409	CAA	2	6	1714	1719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261403875
17	NC_013409	AAC	2	6	1748	1753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261403875
18	NC_013409	CT	4	8	1761	1768	0 %	50 %	0 %	50 %	261403875
19	NC_013409	ATC	2	6	1795	1800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261403875
20	NC_013409	ATATA	2	10	1912	1921	60 %	40 %	0 %	0 %	261403875
21	NC_013409	T	6	6	1969	1974	0 %	100 %	0 %	0 %	261403875
22	NC_013409	CTAA	2	8	2009	2016	50 %	25 %	0 %	25 %	261403875
23	NC_013409	ATA	3	9	2074	2082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261403875
24	NC_013409	ATC	2	6	2095	2100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261403875
25	NC_013409	TCA	2	6	2165	2170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261403875
26	NC_013409	CCT	2	6	2189	2194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261403875
27	NC_013409	TCC	2	6	2222	2227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261403875
28	NC_013409	ATT	2	6	2239	2244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261403875
29	NC_013409	ATCAA	2	10	2258	2267	60 %	20 %	0 %	20 %	261403875
30	NC_013409	TC	4	8	2331	2338	0 %	50 %	0 %	50 %	261403875
31	NC_013409	ATGT	2	8	2380	2387	25 %	50 %	25 %	0 %	261403875
32	NC_013409	TTA	2	6	2399	2404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261403875
33	NC_013409	TCC	2	6	2420	2425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261403875
34	NC_013409	C	6	6	2505	2510	0 %	0 %	0 %	100 %	261403875
35	NC_013409	CCTG	2	8	2570	2577	0 %	25 %	25 %	50 %	261403875
36	NC_013409	ATT	2	6	2605	2610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261403875
37	NC_013409	CT	3	6	2628	2633	0 %	50 %	0 %	50 %	261403875
38	NC_013409	CAA	2	6	2766	2771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261403875
39	NC_013409	ATC	2	6	2785	2790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261403875
40	NC_013409	TAAA	2	8	2799	2806	75 %	25 %	0 %	0 %	261403875
41	NC_013409	TAA	2	6	2825	2830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261403875
42	NC_013409	TTA	2	6	2904	2909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261403875
43	NC_013409	AAC	2	6	2984	2989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261403875
44	NC_013409	CTT	2	6	3030	3035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261403875
45	NC_013409	GTT	2	6	3057	3062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261403875
46	NC_013409	CT	3	6	3112	3117	0 %	50 %	0 %	50 %	261403875
47	NC_013409	TCC	2	6	3200	3205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261403875
48	NC_013409	AT	3	6	3308	3313	50 %	50 %	0 %	0 %	261403875
49	NC_013409	TAT	2	6	3372	3377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261403875
50	NC_013409	AAT	2	6	3420	3425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261403875
51	NC_013409	TAT	2	6	3456	3461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261403875
52	NC_013409	CAA	2	6	3463	3468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261403875
53	NC_013409	ATA	2	6	3481	3486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261403875
54	NC_013409	ATCC	2	8	3498	3505	25 %	25 %	0 %	50 %	261403875
55	NC_013409	ATC	2	6	3532	3537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261403875
56	NC_013409	TC	3	6	3584	3589	0 %	50 %	0 %	50 %	261403875
57	NC_013409	TCA	2	6	3596	3601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261403875
58	NC_013409	T	7	7	3620	3626	0 %	100 %	0 %	0 %	261403875
59	NC_013409	CTT	2	6	3637	3642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261403875
60	NC_013409	TAA	2	6	3643	3648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261403875
61	NC_013409	AT	3	6	3715	3720	50 %	50 %	0 %	0 %	261403875
62	NC_013409	T	7	7	3729	3735	0 %	100 %	0 %	0 %	261403875
63	NC_013409	ACT	2	6	3817	3822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261403875
64	NC_013409	TAA	2	6	3826	3831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261403875
65	NC_013409	CTT	2	6	3885	3890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261403875
66	NC_013409	T	7	7	3889	3895	0 %	100 %	0 %	0 %	261403875
67	NC_013409	TCT	2	6	3923	3928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261403875
68	NC_013409	TGA	2	6	3943	3948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261403875
69	NC_013409	ATT	2	6	3973	3978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261403875
70	NC_013409	TAA	2	6	4140	4145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261403875
71	NC_013409	GTT	2	6	4150	4155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261403875
72	NC_013409	TATCT	2	10	4174	4183	20 %	60 %	0 %	20 %	261403875
73	NC_013409	AATT	2	8	4201	4208	50 %	50 %	0 %	0 %	261403875
74	NC_013409	AAC	2	6	4244	4249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261403875
75	NC_013409	AAT	2	6	4253	4258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261403875
76	NC_013409	T	7	7	4279	4285	0 %	100 %	0 %	0 %	261403875
77	NC_013409	TAA	2	6	4306	4311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261403875
78	NC_013409	TG	3	6	4320	4325	0 %	50 %	50 %	0 %	261403875
79	NC_013409	CTTT	2	8	4330	4337	0 %	75 %	0 %	25 %	261403875
80	NC_013409	TTG	2	6	4454	4459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261403875
81	NC_013409	ATT	2	6	4465	4470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261403875
82	NC_013409	TAC	2	6	4473	4478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261403875

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.